猫狗自古就水火不容，这部动画更是将它们卷入一场势不两立的战斗当中。在这里，猫是最邪恶不过的动物，它们貌似平静温顺，却在暗中紧锣密鼓筹划着统治地球的阴谋。狗则是人类最忠实的保护者，他们忠心耿耿，要把危害人类的猫类“赶尽杀绝”。猎犬小卢正是这么一只身负重任的狗。因为，它得知了猫们正在野心勃勃，要毁灭狗类

距离第二部后猫狗休战已经过去10年了，猫狗两家共同发明了一种监控系统，维持和平化解冲突。然而当一只精通技术的鹦鹉出现，利用自己的“黑客”技术入侵，并使用猫和狗才能听到的频率来操控它们，世界各地再度爆发猫狗大战！于是，一群没有经验的新手猫狗特工要用最原始的方式来恢复和平。